Кафедра Кибернетики и Мехатроникив Российском университете дружбы народов была основана в 1993. Кафедру возглавил К.А. Пупков. Первый выпуск бакалавров состоялся в 1997 году, магистров - в 1999 году. В настоящее время по кафедре специализируются более 280 студентов и 23 аспиранта (иностранные - 35%, российские и СНГ – 65%). Выпускники кафедры являются специалистами в области разработки и исследования алгоритмического, программного и технического обеспечения современных средств автоматизации, систем управления и обработки информации в различных областях техники и производства.

Преподавательский коллектив кафедры традиционно имеет высокую квалификацию. В настоящее время на кафедре работают 8 профессоров, 8 доцентов и 10 ассистентов, многие из которых являются сотрудниками МГТУ им. Баумана, МИФИ, МИЭМ, РГГУ, Вычислительного центра им. А.А. Дородницына РАН, Института проблем управления им. В.А. Трапезникова РАН, Российского научного центра им. И. В. Курчатова. Результаты научной деятельности сотрудников обобщены в большом числе монографий и учебных пособий.